Основные файлы

Прямая последовательность

Обратная последовательность

Fasta выравнивание

Jalview проект

Проблемные нуклеотиды

На изображении выше показаны участки с проблемными нуклеотидами. Сверху нахождятся прямые последовательности, а снизу обратные.

1) 8й и 9й нуклеотид были помечены как N, посмотрев на обратную последовательность, я выяснил, что это были A и G

2) 259й нуклеотид был помечен как N на обратной последовательности, на прямой он был помечен как G

3) Участок в районе 300го нуклеотида был плохого качества, а сам он был помечен как N. На прямой последовательности он был хорошего качества

4) Участок в районе 349го нуклеотида был плохого качества, а сам он был помечен как N. На прямой последовательности он был хорошего качества

О хроматограмме:

прямая послед-ть нечитаема с 0 по 16 нуклеотид, обратная с 0 по 31. Обе хроматограммы хорошего качества, но обратна€ лучше. Шум составляет в среднем до 2% хроматограммы

Плохая хроматограмма

На данном участке последовательность нечитаема так как шум находится на уровне сигнала.